当前气相色谱仪的应用十分广泛，通过对它的使用，有助于行业的快速发展。当然在进行使用的时候，为了将相关效能更好发挥出来，不仅要对它的工作原理有所了解，还应当要明确具体操作步骤，掌握相关注意事项，相对而言就显得尤为重要。在进行使用的时候，就应当要对规定的环境条件有所了解，在某些环境条件不符，或者不具备的时候，就应当要采取相应的措施。仪器应当要按照操作规程，认真细心地进行操作。
不管使用什么样的检测器，在将气象色谱仪启动之前，都应当要先通上载气，尤其是在开热导池电源开关的时候，应当要检查气路是否接在热导上，否则将开关打开的时候，就会将钨丝烧断的危险。不仅如此仪器的汽化加热电路，接线内直接接有220V电压，因此只有在主机关闭的时候，才能装接插头座，否则将烧毁接线及电子元件。在开机测试的时候，则应当要注意，防止温度过高，导致固定液蒸，而影响检测器工作。长期工作的情况下，仪器内部温度会不断升高，为此就会造成误差。在这种情况下，就应当要在仪器的左边侧面，备有测温孔，主要的目的在于，方便对水银温度计的使用，能够对层析室精确温度直接测量。
在对针形阀及稳压阀调节的时候，则应当要缓慢进行。稳压阀只有在阀前后压差，大于0.05MPA的条件下，才能起到稳压作用。稳压阀不工作的时候，就应当要放松调节手柄，主要的目的在于，防止波纹管因长期受力疲劳而失效。氢气及氮气是检测器常用的载气，因而需要确保纯度。液相色谱仪的预热，稳定时间是四个小时左右，能适应二十四小时连续工作。通常情况下，能够连续工作一周以上。