在仪器发明之前，人们利用相似相容的原理将有机物从混合物中提取出来，随着有机物种类不断增加，这种方法再也不能满足人们提纯需求，这就需要用更精确得方法进行提纯。有机物除了可以溶于有机溶剂外还有其它特性，比如不同物质的吸收光谱不同、物化性质不同，利用这些方面的差异就可以实现有机物提纯，有的仪器甚至可以实现自动提纯。
制备液相色谱仪的自动操作表现为多个方面。机器在进样之前可以自动检查有无故障，没有故障样品可以自动进入，有的话通过指令提醒操作人员，如遇设备故障人们可以快速找到问题所进行针对性维修；在一次实验中，不用于普通液相色谱仪，它的波长保持稳定不用手动调节；可以自动记录仪器开机时间、灯的状态等，给人们提供直观的设备信息。如有人出现操作错误，仪器也能自动检测到，通过显示错误指令提醒人们。以自动化的操作系统确保实验的准确性和效率性。
说起提纯就不能忽略固相萃取这个方法，它是很多产品成分检验中样品前处理的重要方式，固相萃取装置就是以它为原理进行自动化提纯的仪器。纯化效果比较突出的要数全自动固相萃取仪，它的自动化程度高，除了软件参数设定几乎不需要人工操作。它自动调节萃取柱尺寸选择合适目标物质的型号，利用多个尺寸的萃取柱可以实现各种有机物的提纯；自动加载样品，自动萃取仪可以一次纯化六个样品，提纯结束后继续下一组样品的纯化操作；自动洗脱萃取柱进行分离纯化，溶剂从萃取柱上端加入，流通整个柱子使目标物质全面洗脱下来，提高回收率；最后通过旋转收集瓶的架子完成自动收集过程。